產(chǎn)品名稱(chēng):NGS Fast Ligation Module
中文名稱(chēng):NGS 快速連接模塊
產(chǎn)品編號與包裝規格:
編號 | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規格 | 產(chǎn)品介紹 | 價(jià)格 |
HKM066A | NGS Fast Ligation Module | 24次/盒 | 預混酶模塊(NGS 快速連接) | 2745 |
產(chǎn)品描述:
NGS Fast Ligation module 是專(zhuān)門(mén)針對于 illumina 高通量測序平臺所優(yōu)化的預混酶模塊。使用本模塊可以將 3'端 帶有 dA 尾的 DNA 片段與 adapter 進(jìn)行快速連接。與常規方法比較,本模塊采用了一步法反應流程,NGS DNA Fragmentation/End Repair/dA-Tailing Module 或 NGS DNA End Repair/dA-Tailing Module 反應后所獲得的片段后 DNA,無(wú)需磁珠純化,可使用本模塊直接與 adapter 進(jìn)行連接,省去了多步磁珠純化步驟,操作更加簡(jiǎn)便,文庫轉 化效率更高。
適用范圍:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫片段的快速連接(如 NGS DNA Fragmentation Module 和 EndRepair/dA-tailing Module 處理后的產(chǎn)物)。
適用樣本量:1ng -1μg DNA。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1) 無(wú)需磁珠純化,可直接將 DNA adapter 與帶有 dA-Tailing 的 DNA 片段連接;
2) 連接效率高,可進(jìn)行微量樣本的 DNA adapter 連接。
注意事項:
1、開(kāi)始實(shí)驗前,對 DNA 濃度精確定量至關(guān)重要,推薦 DNA 上樣量為 1ng-1μg。DNA可溶解于去離子水、10 mM Tris Buffer EB 或 0.1×TE 等。
2、推薦 DNA 的上樣量指的是片段化后的 dsDNA 的量。推薦 使用 Qubit、Picogreen 或者其他染料法對 DNA 濃度進(jìn)行精確定 量。
3、請確認 DNA 溶液中不含陽(yáng)離子及螯合劑,如果 DNA 溶解 于 1×TE 或不確定 DNA 溶液中的 EDTA 濃度,需先對 DNA 進(jìn)行純化后再進(jìn)行片段化反應。
保存條件:-20℃保存,盡量避免反復凍融。
NGS Fast Ligation Module 產(chǎn)品組成:
A 包裝(24 次) | B 包裝(96 次) | |
Adapter-ligation Enzyme | 120μl | 480μl |
Adapter-ligation Buffer | 1ml×2 | 1ml×5 |
RNase Free Water | 1ml | 1ml×2 |
操作步驟:
1,根據經(jīng) NGS DNA Fragmentation Module 和 End Repair/dA-Tailing Module 處理后的產(chǎn)物的量,計算使用接頭 的量并按照下表對接頭濃度進(jìn)行稀釋?zhuān)?table cellpadding="0" cellspacing="0" style="border-collapse:collapse;width:65%;">
2,按照下表所示各組分用量配制反應體系,并將配制完成的反應體系輕柔混勻后置于冰上
名稱(chēng) | 體積 |
dA-tailed DNA | 40μl |
Adapter -Ligation Buffer | 50μl* |
Adapter -Ligation Enzyme | 5μl |
DNA Adapter | 5μl** |
Total volume | 100μl |
注:* Adapter -Ligation Buffer 長(cháng)時(shí)間放置會(huì )有白色沉淀,用前請上下顛倒、振蕩,使液體中白色沉淀充分溶 解并瞬時(shí)離心后使用。
**本公司接頭濃度為 10μM,請根據片段化 dsDNA 量對接頭進(jìn)行稀釋?zhuān)铀a齊,使接頭體積為 5μl。
3,將此配制好的 100μl連接反應液輕柔吸打混勻,置于 PCR 儀中,反應程序如下:
溫度 | 時(shí)間 |
熱蓋 105℃ | off |
16℃ | 15min |
4℃ | Hold |
注:當片段化 dsDNA 量較低,實(shí)驗效果不理想時(shí),可嘗試將連接時(shí)間延長(cháng)一倍。
4,連接產(chǎn)物磁珠純化(Post Ligation Clean Up) 該步驟使用磁珠對連接產(chǎn)物進(jìn)行純化或分選。純化可除去未連 接的 Adapter 或 Adapter Dimer 等無(wú)效產(chǎn)物。